El L.T.I. dispone actualmente de los siguientes aparatos, kits y reactivos relacionados con el análisis de ácidos nucleicos:

• Secuenciador MegaBACE 500 (Amersham Biosciences). Separación por electroforesis capilar (48 capilares). Capacidad de detección de 4 fluoróforos simultáneamente.

• Secuenciador ALF (Amersham Biosciences). Separación por geles de poliacrilamida. Capacidad 10 clones. Detección de un solo fluoróforo.

• Pyrosecuenciador PSQ^TM96 MA de Biotage. Basado en la tecnología de “pyrosequencing” que utiliza una reacción en cascada de 4 enzimas y sustratos específicos con el resultado de producción de luz por cada nucleótido incorporado. La detección se realiza a tiempo real mediante una cámara CCD de alta sensibilidad.

Características: capacidad de 1 a 96 muestras en placa de PCR, permite analizar SNPs, mutaciones, inserciones/deleciones, estudios de frecuencia alélica, haplotipos, etc, posibilidad de trabajo en modo “multiplexing” hasta 3 muestras en un único pocillo, tiempo de análisis alrededor de 15 minutos/placa de PCR.

• Analizador de DNA Modelo 4300S de Li-Cor. Detección rápida de polimorfismos (SNPs, inserciones, delecciones o variaciones de tamaño de microsatélites). Está basado en la electroforesis del DNA en gel de poliacrilamida con detección simultánea de fluorescencia infrarroja a 685 y 785 nm, generando una doble imagen de 16 bit que se puede analizar en softwares convencionales de tratamiento de imágenes. Capacidad de procesar 24, 48 o 96 muestras simultáneamente según el peine usado.

• PCR cuantitativa ABI PRISM 7000 (Applied Biosystem).

• PCR cuantitativa SmartCycler (Cepheid).

• Termociclador en gradiente PTC-200 (MJ Research).

• Polimerizador de geles por luz UV ReproSet (Amersham Biosciences).

• Kit de purificación de DNA GFX Micro plasmid prep (Amersham Biosciences).

• EXO SAP (Amersham Biosciences).

• Kit de secuenciación MegaBACE DYEnamic ET dye terminator kit (Amersham Biosciences).

• Kit de secuenciación Thermosequenase cycle sequencing kit (Amersham Biosciences).

• Kit de SNP MegaBace SnuPe genotyping kit (Amersham Biosciences).

• MegaBACE ET400-R size standard.

• MegaBACE SnuPe Multiple Injection Marker.

El Servicio cuenta con los programas informáticos adecuados para el tratamiento de los resultados. Dichos programas están también a disposición de los usuarios pertenecientes a Departamentos de la Universidad de León.

• Sequencing software suite v3.0: Para ver y editar secuencias. Los fluorogramas pueden abrirse también con el programa "Chromas", disponible en la web en la dirección:
www.technelysium.com.au/chromas14x.html

• Genetic Profiler v2.2: Para el genotipado de microsatétites y análisis de fragmentos en general.

• SNP Profiler v1.0: permite la detección de los SNPs y la asignación automatica de alelos.

• Primer Express v2.0: Para el diseño óptimo de cebadores y sondas.

• PSQ Assay Design

• PSQ 96MA 2.1.1.