Guia docente
DATOS IDENTIFICATIVOS 2020_21
Asignatura PROTEÓMICA E INGENIERÍA DE PROTEÍNAS Código 00208045
Enseñanza
0208 - GRADO EN BIOTECNOLOGÍA
Descriptores Cr.totales Tipo Curso Semestre
6 Obligatoria Cuarto Segundo
Idioma
Castellano
Ingles
Prerrequisitos
Departamento BIOLOGIA MOLECULAR
Responsable
RODRÍGUEZ OLIVERA , ELÍAS
Correo-e erodo@unileon.es
cbarm@unileon.es
Profesores/as
RODRÍGUEZ OLIVERA , ELÍAS
BARREIRO MENDEZ , CARLOS
Web http://
Descripción general
Tribunales de Revisión
Tribunal titular
Cargo Departamento Profesor
Presidente BIOLOGIA MOLECULAR RUA ALLER , FRANCISCO JAVIER
Secretario BIOLOGIA MOLECULAR LUENGO RODRIGUEZ , JOSE MARIA
Vocal BIOLOGIA MOLECULAR FERRERO GARCIA , MIGUEL ANGEL
Tribunal suplente
Cargo Departamento Profesor
Presidente BIOLOGIA MOLECULAR VALLE FERNANDEZ , MARIA DEL PILAR DEL
Secretario BIOLOGIA MOLECULAR MARTINEZ BLANCO , HONORINA
Vocal BIOLOGIA MOLECULAR RODRIGUEZ APARICIO , LEANDRO B.

Competencias
Código  

Resultados de aprendizaje
Resultados Competencias
1. Conocer las metodologías utilizadas en la investigación del conjunto de proteínas de una muestra biológica (proteoma) y de sus cambios en respuesta a distintos factores (proteómica diferencial). 2. Conocer las técnicas utilizadas en la determinación de la estructura de proteínas. 3. Conocer las metodologías utilizadas en el estudio de las interacciones entre proteínas (técnicas bioquímicas de afinidad, sistemas de expresión en levaduras y fagos, etc) y la organización de dichas proteínas en redes funcionales. 4. Conocer las metodologías utilizadas en ingeniería de proteínas, tales como diversos métodos de diseño (modelización computacional, diseño modular) y técnicas de evolución dirigida de proteínas. 5. Conocer las principales bases de datos de proteínas y recursos informáticos de análisis y modelado de estructuras de proteínas, y de predicción de estructuras secundarias y modificaciones posttraduccionales. 6. Conocer las metodologías utilizadas en el diseño de ligandos de proteínas y diversas técnicas de análisis de unión de dichos ligandos. 7. Conocer diversas técnicas de modificación de las propiedades de las proteínas (mutagénesis dirigida, modificación química).

Contenidos
Bloque Tema
1. Proteómica. Técnicas de estudio del proteoma.
2. Proteómica diferencial.
3. Proteómica estructural.
4. Interactómica. Técnicas de análisis de interacciones entre proteínas. Redes de proteínas.
5. Ingeniería de proteínas.
6. Principios de modelado de proteínas. Diseño de proteínas y ligandos. Bases de datos de proteínas y recursos informáticos de análisis y modelado.
7. Evolución dirigida de proteínas y ligandos.
8. Modificación química de proteínas.

Planificación
Metodologías  ::  Pruebas
  Horas en clase Horas fuera de clase Horas totales
Practicas a través de TIC en aulas informáticas 4 6 10
 
Presentaciones/exposiciones 12 18 30
Prácticas en laboratorios 10 15 25
 
Sesión Magistral 30 51 81
 
Pruebas de desarrollo 4 0 4
 
(*)Los datos que aparecen en la tabla de planificación són de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos

Metodologí­as
Metodologías   ::  
  descripción
Practicas a través de TIC en aulas informáticas Manejo de bases de datos y de programas de modelización de estructuras
Presentaciones/exposiciones Exposición de seminarios por parte de los alumnos.
Prácticas en laboratorios Purificación y modificación química de proteínas
Sesión Magistral Lecciones magistrales impartidas por los profesores

Tutorías
 
Sesión Magistral
Presentaciones/exposiciones
descripción
Las tutorias serán siempre discrecionales, a petición del alumnado, en cualquier momento que los alumnos, individual o colectivamente, consideren necesario, tras consensuar con los profesores de la asignatura la forma, el sitio y el horario de realización de las mismas.

Evaluación
  descripción calificación
Prácticas en laboratorios Calificación del Guión de Prácticas de Laboratorio y del Aula de Informática 15%
Presentaciones/exposiciones Calificación de los Seminarios impartidos por los Alumnos.
25%
Pruebas de desarrollo Calificación del Examen escrito sobre las Clases Teóricas, y Prácticas de Laboratorio y del Aula de Informática 60%
 
Otros comentarios y segunda convocatoria

La asistencia a las prácticas de laboratorio y las realizadas en el aula de informática es obligatoria. La no asistencia implicará NO SUPERAR la parte práctica de la evaluación.

Todos los alumnos habrán de realizar los seminarios y las actividades sobre los mismos. La no realización implicara NO SUPERAR esa parte de la evaluación.

Cada una de las actividades contempladas en el desarrollo de la asignatura (pruebas sobre el temario teórico, seminarios o prácticas) habrán de ser superadas con una calificación de 5.0 sobre 10 puntos. En caso de no superar alguna de las actividades se considerará NO SUPERADA la asignatura.

En la segunda convocatoria de la asignatura habrán de superarse las actividades suspensas en la primera convocatoria de la asignatura.


ADENDA
Plan de contingencia para una situación de emergencia que impida actividades docentes presenciales
Enlace de acceso a la Adenda de la Guia docente por el COVID-19


Fuentes de información
Acceso a la Lista de lecturas de la asignatura

Básica D Thangadurai, J Sangeetha, Genomics and Proteomics, CRC Press, 2015
Conn, P.M., Handbook of Proteomic Methods, Humana Press, 2003
NC Mishra, Introduction to proteomics, John Wiley and Sons, 2010
Twyman, R.W., Principles of Proteomics., Bios Scientific Publ., 2004
CH Wu, CN Arighi, KE Ross, Protein Bioinformatics, Springer Nature, 2017
Simpson, R., Proteins and Proteomics: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2003
Westermeier, R. and Naven, T. , Proteomics in Practice: A Laboratory Manual of Proteome Analysis, Wiley-VCH, 2002

Complementaria


Recomendaciones


Asignaturas que se recomienda haber cursado previamente
TÉCNICAS INSTRUMENTALES I / 00208004
BIOQUÍMICA / 00208011
BIOINFORMÁTICA / 00208021
GENÓMICA / 00208024
INGENIERÍA GENÉTICA MOLECULAR / 00208029
TÉCNICAS INSTRUMENTALES II / 00208032