Guia docente

DATOS IDENTIFICATIVOS

2020_21

Asignatura

GENÓMICA Y PROTEÓMICA

Código

01736014

Enseñanza

1736 - MASTER UNIVERSITARIO EN INVESTIGACION EN BIOLOGIA FUNDAMENTALY BIOMEDICINA

Descriptores

Cr.totales

Tipo

Curso

Semestre

Optativa

Primer

Anual

Idioma

Castellano

Ingles

Prerrequisitos

Departamento

PRODUCCION ANIMAL

Responsable

MARQUÉS MARTÍNEZ , MARGARITA

Correo-e

mmarm@unileon.es
maferg@unileon.es
bgutg@unileon.es
arodg@unileon.es
lesaec@unileon.es
cbarm@unileon.es
jgutg@unileon.es
cgpolp@unileon.es
asuav@unileon.es

Profesores/as

FERRERO GARCÍA , MIGUEL ÁNGEL

GUTIÉRREZ GIL , BEATRIZ

MARQUÉS MARTÍNEZ , MARGARITA

RODRÍGUEZ GARCÍA , ANTONIO

SÁENZ DE MIERA CARNICER , LUIS ENRIQUE

BARREIRO MENDEZ , CARLOS

GUTIERREZ GONZALEZ , JUAN JOSE

POLANCO DE LA PUENTE , CARLOS GASPAR

SUAREZ VEGA, AROA

Web

http://www.unileon.es/estudiantes/estudiantes-master/oferta-titulaciones/mu-metodologia-investigacion-biologia-biomedicina/plan-estudios?id=0212014&curso=2013

Descripción general

Esta materia presenta una introducción a los fundamentos de la Genómica y la Proteómica, disciplinas clave para un amplio rango de áreas de investigación en las ciencias biológicas. La asignatura está diseñada para que los alumnos adquieran conocimientos y habilidades sobre las herramientas utilizadas por la Genómica y la Proteómica, utilizando enfoques prácticos y haciendo énfasis en el potencial de estas tecnologías.

Tribunales de Revisión

Tribunal titular
Cargo	Departamento	Profesor
Presidente	BIOLOGIA MOLECULAR	FERNANDEZ LOPEZ , ARSENIO
Secretario	BIOLOGIA MOLECULAR	GIL SANTOS , JOSE ANTONIO
Vocal	MEDICINA,CIRUGIA Y ANAT.VETERI	PEREZ GARCIA , CARLOS CESAR

Tribunal suplente
Cargo	Departamento	Profesor
Presidente	BIOLOGIA MOLECULAR	HERRÁEZ ORTEGA , MARÍA PAZ
Secretario	PRODUCCION ANIMAL	ARRANZ SANTOS , JUAN JOSE
Vocal	MEDICINA,CIRUGIA Y ANAT.VETERI	DIEZ PRIETO , INMACULADA

Competencias

Tipo A	Código	Competencias Específicas
	A17407	1736CE11 Capacidad para formular, reconocer y realizar estudios de investigación genómica, proteómica, de ingeniería genética y de análisis genético de microorganismos, animales y plantas.
	A17409	1736CE3 Capacidad para plantear y realizar ensayos según los PNT ( Protocolos Normalizados de Trabajo) , para utilizar el equipamiento científico adecuado y para la identificación y cuantificación de moléculas biológicas.
Tipo B	Código	Competencias Generales y Transversales
	B5400	1736CG1 Proporcionar una formación teórico-práctica de los fundamentos metodológicos de investigación básica y aplicada para el desarrollo de actividades de I+D+I en Biología Fundamental, Biomedicina y Veterinaria orientada a seguir estudios posteriores y al ejercicio profesional.
	B5402	1736CG3 Aprender a buscar información, a seleccionarla,a reunir e interpretar datos relevantes sobre diferentes temas.
	B5403	1736CG4 Conseguir habilidades en el planteamiento de experimentos, planificación del trabajo, uso racional de los medios y de los recursos, recogida y análisis de los datos, su registro fiel, análisis, presentación y defensa de los mismos.
	B5404	1736CT1 Expresión oral y escrita
	B5405	1736CT10 Trabajo en equipo
	B5406	1736CT11 Adaptación a nuevas situaciones, iniciativa y espiritu emprendedor
	B5407	1736CT12 Pensamiento crítitco
	B5408	1736CT13 Mantener un compromiso ético
	B5409	1736CT2 Solucion de problemas
	B5410	1736CT3 Utilizar Internet como medio de comunicación y como fuente de información
	B5411	1736CT4 Habilidad de comunicación
	B5412	1736CT5 Organizar y planificar el trabajo
	B5413	1736CT6 Tomar decisiones
	B5414	1736CT7 Liderazgo
	B5415	1736CT8 Capacidad de autoevaluación
	B5416	1736CT9 Creatividad
Tipo C	Código	Competencias Básicas
	C1	Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.
	C2	Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios.
	C3	Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones (y los conocimientos y razones últimas que las sustentan) a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades.
	C4	Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.
	C5	Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación

Resultados de aprendizaje

Resultados	Competencias
- Comprender los fundamentos de las principales técnicas de Genómica y Proteómica y actualizar conocimientos de las nuevas metodologías en estas disciplinas.	A17407 A17409	B5400 B5402 B5403 B5404 B5405 B5406 B5407 B5408 B5409 B5410 B5411 B5412 B5413 B5414 B5415 B5416	C1 C2 C3 C4
- Utilizar recursos informáticos para el análisis de genomas, transcriptomas y secuencias de proteínas.	A17407 A17409	B5400 B5402 B5403 B5404 B5405 B5406 B5407 B5408 B5409 B5410 B5411 B5412 B5413 B5414 B5415 B5416	C1 C2 C3 C4 C5
- Aplicar de forma independiente protocolos básicos de electroforesis bidimensional de proteínas.	A17407 A17409	B5400 B5402 B5403 B5404 B5405 B5406 B5407 B5408 B5409 B5410 B5411 B5412 B5413 B5414 B5415 B5416	C1 C2 C3 C4

Contenidos

Bloque

Tema

Bloque I.

1. Marcadores genómicos: plataformas de genotipado de alto rendimiento y su aplicación al desarrollo de sistemas automatizados de identificación y diagnóstico.
2. Secuenciación de nueva generación y manipulación avanzada de secuencias de DNA: alineamientos, formatos y calidad de secuencias.
3. Estudios de asociación de genoma completo.
4. Análisis de la expresión génica diferencial mediante la tecnología de micromatrices y de secuenciación masiva (RNAseq).
5. Epigenómica. Fundamentos de genómica funcional y comparada.
6. Electroforesis bidimensional de proteínas.
7. Análisis de proteínas por espectrometría de masas (digestión tríptica de proteínas, huella peptídica, búsquedas en MASCOT).
8. Etiquetado de proteínas.

Planificación

Metodologías :: Pruebas
	Horas en clase	Horas fuera de clase	Horas totales
Prácticas en laboratorios	20	20	40

Tutorías	10	5	15
Presentaciones/exposiciones	4	12	16
Practicas a través de TIC en aulas informáticas	50	75	125
Trabajos	6	18	24

Sesión Magistral	10	20	30


(*)Los datos que aparecen en la tabla de planificación són de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos

Metodologías

Metodologías ::

	descripción
Prácticas en laboratorios	Ensayos experimentales en el laboratorio. Los estudiantes realizarán un protocolo de interés siguiendo buenas prácticas de laboratorio. En dichas sesiones se discutirán, por parte de los estudiantes y el profesor, los resultados obtenidos, analizando su importancia e interés.
Tutorías	Tiempo que cada profesor tiene reservado para atender y resolver dudas de los alumnos.
Presentaciones/exposiciones	Preparación de memorias escritas, exposiciones orales o seminarios sobre un trabajo experimental o bibliográfico.
Practicas a través de TIC en aulas informáticas	Resolución de problemas y casos. Simulaciones a través de TIC en aulas de informática. Realización de tareas en grupo guiadas por el profesor.
Trabajos	Análisis de artículos científicos relevantes sobre temas actuales relacionados con la materia. Realización de tareas autónomas online. Realización de tareas en grupo guiadas por el profesor.
Sesión Magistral	Exposición y discusión de los contenidos de la materia.

Tutorías

Sesión Magistral

Prácticas en laboratorios

Presentaciones/exposiciones

descripción

Tutorías especializadas presenciales y online mediante plataformas educativas de apoyo.

Evaluación

	descripción	calificación
Sesión Magistral	Evaluación continua complementada con pruebas teórico-prácticas realizadas durante el curso en las que se evaluarán los contenidos de las sesiones teóricas.	Ponderación mínima: 30.0 Ponderación máxima: 100.0
Prácticas en laboratorios	Evaluación continua con valoración del trabajo diario en el laboratorio (participación, orden, limpieza, manipulación de equipamiento, material, muestras y animales, atención, interés y registro anotado de datos…). Se evaluará el manejo de herramientas informáticas y la capacidad de interpretación y discusión de los resultados.	Ponderación mínima: 30.0 Ponderación máxima: 100.0
Presentaciones/exposiciones	Evaluación de la estructura, calidad, fuentes bibliográficas empleadas, claridad y corrección en la redacción de la presentación, y la capacidad de expresión oral.	Ponderación mínima: 30.0 Ponderación máxima: 100.0

Otros comentarios y segunda convocatoria
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ADENDA

Plan de contingencia para una situación de emergencia que impida actividades docentes presenciales

Enlace de acceso a la Adenda de la Guia docente por el COVID-19

Fuentes de información

Acceso a la Lista de lecturas de la asignatura

Básica
	BENFEY PH.N. & PROTOPAPAS A.D. (2005). Genomics. Pearson Prentice Hall. DUBITZKY W.; GRANZOW M. & BERRAR, D.P. (2007). Fundamentals of data mining in Genomics and Proteomics. Springer. LESK, A. (2017). Introduction to Genomics. Oxford University Press. O’CONNOR C.D. & HAMES B.D. (2007). Proteomics. Blackwell. PEVSNER J (2009). Bioinformatics and functional genomics. Willey-Blackwell. PRIMROSE S.B. & TWYMAN R.M. (2003). Genomics: Applications in human biology. Wiley. RUVINSKY A.& MARSHALL GRAVES J.A. (2005). Mammalian genomics. CABI Publishing. VLAHOU A. (2008). Clinical Proteomics. Methods and Protocols Series: Methods in Molecular Biology, Vol. 428. Springer. WESTERMEIER R., NAVEN T. & HÖPKER H-R. (2008). Proteomics in practice: a guide to successful experimental design. Wiley-VCH.
Complementaria

Recomendaciones